Przewiduje się w nim następujące obszary tematyczne:

• integrowana ochrona roślin oraz ograniczanie zagrożeń związanych ze stosowaniem środków ochrony roślin dla ludzi, zwierząt i środowiska,
• ochrona terytorium Rzeczypospolitej Polskiej przed przedostawaniem i rozprzestrzenianiem się organizmów kwarantannowych i innych stanowiących szczególne zagrożenia.

Program wieloletni będzie realizowany przez Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy w Poznaniu, który na potrzeby jego realizacji zaangażuje infrastrukturę oraz wkład rzeczowy w postaci sprzętu, wyposażenia laboratoriów i bazy analitycznej.

Zgodnie z przyjętymi założeniami merytorycznymi program ma na celu realizację zadań z zakresu ochrony upraw oraz zapewnienia bezpieczeństwa żywności, wypełniając w tym zakresie zobowiązania wynikające z przepisów Unii Europejskiej. Stanowi on również praktyczne wsparcie polskiego rolnictwa w zakresie:

• wdrożenia zasad integrowanej ochrony roślin obowiązujących od dnia 1 stycznia 2014 r.,
• opracowania strategii zwalczania organizmów kwarantannowych stanowiących szczególne zagrożenie dla upraw.

Program wieloletni ma na celu także wsparcie konkurencyjności polskiego rolnictwa na rynku Unii Europejskiej oraz ograniczanie ryzyka powstawania barier pozataryfowych w kontaktach handlowych z państwami trzecimi związanych z występowaniem organizmów kwarantannowych i bezpieczeństwem żywności.

Zadania realizowane w ramach programu będą oddziaływały pozytywnie na środowisko między innymi poprzez opracowanie narzędzi umożliwiających racjonalne stosowanie chemicznych środków ochrony roślin, które są jedną z przyczyn jego degradacji w postaci zanieczyszczenia gleb i wód.