Badania Mikrobiologiczne
Genomiczne spostrzeżenia na temat wielogatunkowego kompleksu patogenów bakteryjnych powodującego bakteryjną plamistość pieczarek białych

Linki do autorów: otwórz panel nakładki
Sameerika D. Mudiyanselage a
,
Michelle Lee a
,
Jose C. Huguet-Tapia a
,
Romina Gazis b
,
Samuel J. Martins a

https://doi.org/10.1016/j.micres.2026.128532

Streszczenie
Bakteryjna plamistość pieczarek białych (Agaricus bisporus) pozostaje główną przeszkodą dla globalnego przemysłu pieczarek białych (Agaricus bisporus), jednak jej etiologiczna złożoność zostały niedoszacowane. Dzięki analizie genomu i polifazowemu podejściu zastosowanemu do grzybów objawowych zebranych w Stanach Zjednoczonych, odkryliśmy nieoczekiwanie zróżnicowany kompleks gatunków Pseudomonas wywołujących plamistość grzybową. Oprócz klasycznych patogenów (P. tolaasii, P. gingeri, P. agarici i P. „reactans”, P. yamanorum, Pseudomonas sp. NC02), nasze analizy ujawniły uderzającą przewagę P. azotoformans, gatunku wcześniej niekojarzonego z patologią grzybów, obok P. pergaminensis, P. monsensis, P. tensinigenes, P. simiae, Pseudomonas sp. Irchel 3A7, Pseudomonas sp. REP124 i dwóch potencjalnie nowych linii rozwojowych. Genomika porównawcza wykazała wyraźną heterogeniczność w zawartości genomu dodatkowego, przy czym P. azotoformans wykazywał wyjątkową plastyczność genomową, wskazującą na szeroką zdolność adaptacji ekologicznej. Profilowanie metabolitów wtórnych i testy linii białej dodatkowo wyodrębniły specyficzne dla gatunku sygnatury chemotaksonomiczne, podkreślając wieloczynnikowy charakter wirulencji. Podsumowując, niniejsze badanie zapewnia najbardziej kompleksową charakterystykę genomiczną i fenotypową Pseudomonas związanej z plamistością bakteryjną w Ameryce Północnej, obalając długo utrzymywany paradygmat pojedynczego dominującego patogenu. Wykazując, że plamistość bakteryjna jest chorobą wielogatunkową, nasze odkrycia redefiniują jej epidemiologię i kładą podwaliny pod ulepszone strategie diagnostyczne w systemach produkcji pieczarek. Pojawienie się i wysoka częstość występowania P. azotoformans uwypuklają ograniczenia protokołów diagnostycznych skoncentrowanych wyłącznie na klasycznych patogenach plamistości bakteryjnej i podkreślają potrzebę szerszych, opartych na genomice strategii wykrywania. Podsumowując, niniejsze badanie oferuje praktyczne wnioski, które pomogą wzmocnić odporność produkcji i wspierać zrównoważony rozwój uprawy pieczarki białej jako najważniejszej ekonomicznie specjalistycznej uprawy spożywczej na świecie.