Agaricus bisporus, najczęściej uprawiany grzyb jadalny na świecie, reprezentowany jest głównie przez podgatunek var. bisporus i var. burnettii. var. bisporus ma wtórnie homotaliczny cykl życiowy z rekombinacją ograniczoną do końców chromosomów, podczas gdy var. burnettii jest heterotaliczny, a rekombinacja wydaje się równomiernie rozłożona na chromosomach. Aby lepiej zrozumieć związek między składem genomu a różnymi stylami życia, zsekwencjonowaliśmy de novo homokaryona burnettii i zsynchronizowaliśmy adnotacje genów ze zaktualizowanymi wersjami opublikowanych genomów var. bisporus. Genomy złożono w chromosomy od telomerów do telomerów i wygenerowano spójny zestaw prognoz genów. Genomy obu podgatunków były w dużej mierze współliniowe, a zwłaszcza końce chromosomów różniły się zawartością modelu genów między dwoma podgatunkami. Na każdym chromosomie znaleziono pojedynczą dużą grupę powtórzeń w tej samej pozycji we wszystkich szczepach, zawierającą prawie 50% wszystkich powtórzeń i prawdopodobnie reprezentującą centromery. Wszystkie powtórzenia były mocno metylowane. Wreszcie, mapująca populacja var. burnettii potwierdził równomierne rozmieszczenie krzyżówek w mejozie, kontrastując z krajobrazem rekombinacji var. bisporus. Nowe odkrycia wykorzystujące wyjątkowo kompletne i dobrze opisane genomy tego basidiomycete pokazują znaczenie dla odkrywania komponentów genetycznych leżących u podstaw różnych cykli życiowych.
Telomere-to-telomere assembled and centromere annotated genomes of the two main subspecies of the button mushroom Agaricus bisporus reveal especially polymorphic chromosome ends
- Anton S. M. Sonnenberg,
- Narges Sedaghat-Telgerd,
- Brian Lavrijssen,
- Robin A. Ohm,
- Patrick M. Hendrickx,
- Karin Scholtmeijer,
- Johan J. P. Baars &
- A. van Peer